Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRAC1Q9NRG0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRAC1Q9NRG0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRAC1Q9NRG0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRAC1Q9NRG0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRAC1Q9NRG0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRAC1Q9NRG0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRAC1Q9NRG0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRAC1Q9NRG0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRAC1Q9NRG0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms