Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPHNQ9NQX3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPHNQ9NQX3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms