Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQQ7

SLC35C2, Solute carrier family 35 member C2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C2Q9NQQ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35C2Q9NQQ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC35C2Q9NQQ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35C2Q9NQQ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms