Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms