Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLDQ9NQC7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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