Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RTN4Q9NQC3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms