Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL40Q9NQ50 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL40Q9NQ50 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms