Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms