Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSU72Q9NP77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms