Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CWC22Q9HCG8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CWC22Q9HCG8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC22Q9HCG8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms