Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8Y1

VRTN, Vertnin, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRTNQ9H8Y1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VRTNQ9H8Y1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VRTNQ9H8Y1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms