Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNDIG1Q9H7V2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms