Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNCQ9H7C4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms