Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSS3Q9H6R3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSS3Q9H6R3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS3Q9H6R3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms