Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XKR8Q9H6D3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR8Q9H6D3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms