Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN3Q9H3W5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms