Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms