Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2J2Q9GZM3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLR2J2Q9GZM3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms