Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCIN1Q9C0H9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRCIN1Q9C0H9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCIN1Q9C0H9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms