Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM6Q9C030 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM6Q9C030 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms