Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRY4Q9C004 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms