Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM3Q9BZQ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM3Q9BZQ6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms