Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUS3Q9BZE2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUS3Q9BZE2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PUS3Q9BZE2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PUS3Q9BZE2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PUS3Q9BZE2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUS3Q9BZE2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUS3Q9BZE2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms