Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIFKQ9BYG3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NIFKQ9BYG3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms