Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PCGF6Q9BYE7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PCGF6Q9BYE7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms