Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL4Q9BYD3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms