Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VN1R3Q9BXE9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms