Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA5Q9BWX5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA5Q9BWX5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GATA5Q9BWX5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA5Q9BWX5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA5Q9BWX5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA5Q9BWX5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA5Q9BWX5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA5Q9BWX5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA5Q9BWX5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA5Q9BWX5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms