Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RPAP1Q9BWH6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPAP1Q9BWH6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP1Q9BWH6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms