Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms