Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PBDC1Q9BVG4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms