Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRACR2AQ9BSW2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRACR2AQ9BSW2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms