Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTKNQ9BST9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTKNQ9BST9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms