Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM175Q9BSA9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms