Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms