Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF8Q9BRL6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF8Q9BRL6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms