Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REEP2Q9BRK0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP2Q9BRK0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
REEP2Q9BRK0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
REEP2Q9BRK0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms