Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD3

KXD1, KxDL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KXD1Q9BQD3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KXD1Q9BQD3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KXD1Q9BQD3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KXD1Q9BQD3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms