Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX2Q9BQ50 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms