Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX50Q9BQ39 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX50Q9BQ39 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms