Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC1Q99614 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC1Q99614 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC1Q99614 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms