Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms