Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms