Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT12Q99456 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms