Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3RQ99062 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF3RQ99062 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms