Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CRBNQ96SW2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CRBNQ96SW2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms