Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK5RAP2Q96SN8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK5RAP2Q96SN8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP2Q96SN8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms