Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1CQ96SD1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms