Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSPG4P5Q96PW8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms