Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UHRF2Q96PU4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms